9月3日，是中国抗日战争胜利65周年纪念日，人民日报发表了题为《纪念中国人民抗日战争暨世界反法西斯战争胜利六十五周年》社论，社论指出：

“中国人民抗日战争的胜利，充分证明了中国共产党是救亡图存、实现民族解放的核心力量。1931年的“九一八事变”和1937年的“七七事变”，把中华民族推到了亡国灭种的边缘。在民族存亡的生死关头，中国共产党吹响了抗击外敌的第一声号角。在那场威武雄壮的战争中，中国共产党以自己的坚定意志和模范行动，在全民族抗战中发挥了中流砥柱的作用。中国人民之所以创造了弱国战胜强国的伟大奇迹，最根本的原因，是中国共产党代表全中国人民的意志，领导和推动了伟大的抗日战争，以自己最富于牺牲精神的爱国主义、不怕流血牺牲的模范行动，支撑起全民族救亡图存的希望，成为夺取抗战胜利的民族先锋。”

据台湾媒体报道，“对于人民日报的论点，马总统相当在意，一早就主动指示总统府对外澄清”。

台湾当局领导人马英九立即指示政府发言人罗智强转述他的意见：对日抗战八年，在中华民国政府的领导下获得最后胜利，当时由国民党执政，这是历史事实，也是唯一的历史真相，人民日报所称“中共领导全民抗战”，与史实不符。罗智强强调：忠于历史，应是两岸当局的公约数，因为，抗战八年，是中华民族的一页血泪历史，任何对这一页历史的缅怀，都必须立足在真实无偏的历史事实上。

罗智强表示：虽然在抗战的过程中，【共】军扮演了一定的角色，但主要战役，如上海保卫战、南京保卫战、武汉保卫战、台儿庄大捷以及最近大陆製拍、以湖南常德保卫战为背景的电影「喋血孤城」，都是国军在前线奋勇抵抗；抗战期间，国军与日军激战，计有会战22次，大型战役1,117次，小型战斗38,931次，二百多位将领捐躯，伤亡官兵高达322万馀人，国军用生命捍卫国家生存、民族血脉，这些历史都不应遗忘，也不应擅改。

  罗志强还引用胡锦涛总书记的讲话来反驳人民日报的有关社论。罗智强表示，2005年9月3日，中共在纪念对日抗战胜利六十周年时，中共总书记胡锦涛在纪念大会上发表讲话，指出对日抗战中，“中国国民党和中国共产党领导的抗日军队，分别担负着正面战场和敌后战场的作战任务，形成了共同抗击日本侵略者的战略态势”。

罗智强说，当时胡锦涛说，“以国民党军队为主体的正面战场，组织了一系列大仗，特别是全国抗战初期的淞沪、忻口、徐州、武汉等战役，给日军以沉重打击。中国共产党领导的敌后战场，广泛发动群众，开展游击战争，八路军、新四军、华南游击队、东北抗日联军和其他人民抗日武装力量奋勇作战。”对此，马总统肯定胡锦涛总书记还原抗战史实的作法，而这也显示【zhonggongdangju】已能正视国军领导对日抗战的史实。

台湾“国防部”也针对人民日报此篇社论发布了新闻稿。新闻稿表示，抗日战争係中华民国国军与全国同胞用鲜血所写下的历史，历经8年赢得的战争，这段史实不容许任何人窜改或任意曲解，相关报导内容与史实不符，国防部严正驳斥。

“国防部”指出，国军自芦沟桥事变起至抗战胜利，8年期间，国军与日军激战，计有会战22次，大型战役1117次，小型战斗38931次，伤亡官兵高达322万馀人，获致最后光荣胜利，绝非中【共】所宣称参与之「平型关战役」相关战果，所能比拟。

而且对日抗战期间，中华民国政府频频参与各项国际会议，与抗战胜利后接受日军降书，皆是国民政府种种领导抗战历史之铁证。

台湾联合晚报记者高凌云撰文指出， 对日八年抗战成两岸间的争议话题。抗战期间，盟国都以国民政府为交涉对象；与日军进行有组织的抵抗，也以国府军队为主，国府亦派出军队支援缅甸战场。国府领导抗战，应为无庸置疑的事。蒋中正与小罗斯福、邱吉尔一同在开罗会谈，更是国府领导抗战的明证。

但是，高凌云在文章最后也语重心长地指出，北京争夺抗战的历史诠释，对于改善两岸关系毫无助益，尊重与保持两岸共同的历史经验，才是两岸能够继续交流的重要基础。以史论史，两岸的政府过去对于抗战都有贡献，兄弟之间，实无必要争个上下，历史就让它归于历史，那是兄弟共有的记忆，是民族共同的血泪，若争个谁打谁没打，怎对得起那些为抵御日寇侵略牺牲的英烈之士。但是中华民国政府应该自己问问，20多年的去中国化，现在，我们不敢称自己是中国人，连国防部都不敢说自己是中国军队，那么又如何告诉世界，是中国军队反抗日本军队的侵略呢？